MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p1BJAB0868

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021730	A	8	8	1	8	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021730	AAC	2	6	21	26	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021730	ACT	2	6	85	90	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021730	ATG	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021730	TGA	2	6	208	213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021730	GCA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021730	TCA	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021730	TGA	2	6	340	345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021730	TTGAT	2	10	402	411	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021730	TAAA	2	8	495	502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021730	AATC	2	8	551	558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021730	CAAA	2	8	588	595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021730	TCA	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021730	CA	3	6	827	832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021730	AAT	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021730	ACT	2	6	916	921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529004
17	NC_021730	ATC	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529004
18	NC_021730	CAT	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529004
19	NC_021730	ATC	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529004
20	NC_021730	AAT	2	6	1185	1190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529004
21	NC_021730	TTA	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021730	AT	4	8	1331	1338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021730	TAAA	2	8	1351	1358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021730	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021730	TAA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021730	AATT	2	8	1397	1404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021730	T	7	7	1439	1445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021730	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021730	A	7	7	1497	1503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021730	GTT	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021730	A	6	6	1538	1543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021730	A	7	7	1567	1573	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
33	NC_021730	A	6	6	1606	1611	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
34	NC_021730	GTG	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523529005
35	NC_021730	TG	3	6	1667	1672	0 %	50 %	50 %	0 %	523529005
36	NC_021730	A	7	7	1675	1681	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
37	NC_021730	TTGGA	2	10	1701	1710	20 %	40 %	40 %	0 %	523529005
38	NC_021730	A	6	6	1755	1760	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
39	NC_021730	TATT	2	8	1762	1769	25 %	75 %	0 %	0 %	523529005
40	NC_021730	A	6	6	1789	1794	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
41	NC_021730	T	6	6	1799	1804	0 %	100 %	0 %	0 %	523529005
42	NC_021730	A	6	6	1938	1943	100 %	0 %	0 %	0 %	523529006
43	NC_021730	TAGA	2	8	1980	1987	50 %	25 %	25 %	0 %	523529006
44	NC_021730	T	7	7	2050	2056	0 %	100 %	0 %	0 %	523529006
45	NC_021730	A	6	6	2124	2129	100 %	0 %	0 %	0 %	523529006
46	NC_021730	AGCGA	2	10	2138	2147	40 %	0 %	40 %	20 %	523529006
47	NC_021730	T	8	8	2166	2173	0 %	100 %	0 %	0 %	523529006
48	NC_021730	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	523529006
49	NC_021730	AGCGAA	2	12	2217	2228	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	523529006
50	NC_021730	AGCGA	2	10	2244	2253	40 %	0 %	40 %	20 %	523529006
51	NC_021730	ATT	2	6	2289	2294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021730	ATA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021730	A	6	6	2473	2478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021730	GA	3	6	2489	2494	50 %	0 %	50 %	0 %	523529007
55	NC_021730	ACTTAG	2	12	2536	2547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523529007
56	NC_021730	AAC	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529007
57	NC_021730	TTG	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523529007
58	NC_021730	ATCA	2	8	2646	2653	50 %	25 %	0 %	25 %	523529007
59	NC_021730	CG	3	6	2714	2719	0 %	0 %	50 %	50 %	523529007
60	NC_021730	A	6	6	2739	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	523529007
61	NC_021730	CTG	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523529007
62	NC_021730	GAA	2	6	2865	2870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529007
63	NC_021730	TAG	2	6	2900	2905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529007
64	NC_021730	TAG	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529007
65	NC_021730	AGAA	2	8	2997	3004	75 %	0 %	25 %	0 %	523529007
66	NC_021730	AAAT	2	8	3079	3086	75 %	25 %	0 %	0 %	523529007
67	NC_021730	AGA	3	9	3166	3174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529007
68	NC_021730	T	6	6	3217	3222	0 %	100 %	0 %	0 %	523529007
69	NC_021730	A	7	7	3386	3392	100 %	0 %	0 %	0 %	523529007
70	NC_021730	A	6	6	3460	3465	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
71	NC_021730	A	6	6	3590	3595	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
72	NC_021730	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529008
73	NC_021730	AAG	2	6	3611	3616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529008
74	NC_021730	TGA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529008
75	NC_021730	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
76	NC_021730	A	6	6	3664	3669	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
77	NC_021730	GAA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529008
78	NC_021730	CAA	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529008
79	NC_021730	CAG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523529008
80	NC_021730	CAC	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523529008
81	NC_021730	ACA	2	6	3808	3813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529008
82	NC_021730	CAA	2	6	3814	3819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529008
83	NC_021730	AAT	2	6	3838	3843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529008
84	NC_021730	CACAA	2	10	3944	3953	60 %	0 %	0 %	40 %	523529008
85	NC_021730	A	6	6	3952	3957	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
86	NC_021730	ATT	2	6	4055	4060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021730	GCT	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021730	AAGA	2	8	4121	4128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021730	AAAAAG	2	12	4143	4154	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021730	ATT	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021730	TGA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021730	AAT	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021730	A	7	7	4237	4243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021730	TAT	2	6	4328	4333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021730	CCA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523529009
96	NC_021730	TTA	2	6	4457	4462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523529009
97	NC_021730	TATTAA	2	12	4500	4511	50 %	50 %	0 %	0 %	523529009
98	NC_021730	TA	3	6	4536	4541	50 %	50 %	0 %	0 %	523529009
99	NC_021730	TCA	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529009
100	NC_021730	TGC	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523529009
101	NC_021730	CTG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523529009
102	NC_021730	TAA	2	6	4834	4839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529009
103	NC_021730	A	6	6	4848	4853	100 %	0 %	0 %	0 %	523529009
104	NC_021730	TAAAC	2	10	4935	4944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021730	ACT	2	6	5067	5072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021730	TAA	2	6	5073	5078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021730	T	6	6	5130	5135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021730	CTT	2	6	5152	5157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021730	AAT	2	6	5161	5166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021730	ATT	2	6	5217	5222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021730	TA	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021730	T	6	6	5242	5247	0 %	100 %	0 %	0 %	523529010
113	NC_021730	AGAC	2	8	5364	5371	50 %	0 %	25 %	25 %	523529010
114	NC_021730	GAA	2	6	5383	5388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529010
115	NC_021730	TGG	2	6	5432	5437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523529010
116	NC_021730	TGA	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529010
117	NC_021730	ATC	2	6	5470	5475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529010
118	NC_021730	GCAAG	2	10	5488	5497	40 %	0 %	40 %	20 %	523529010
119	NC_021730	CA	3	6	5541	5546	50 %	0 %	0 %	50 %	523529011
120	NC_021730	GCTT	2	8	5595	5602	0 %	50 %	25 %	25 %	523529011
121	NC_021730	TGA	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529011
122	NC_021730	CAA	2	6	5708	5713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529011
123	NC_021730	CTTG	2	8	5741	5748	0 %	50 %	25 %	25 %	523529011
124	NC_021730	ATGA	2	8	5783	5790	50 %	25 %	25 %	0 %	523529011
125	NC_021730	ATGCT	2	10	5802	5811	20 %	40 %	20 %	20 %	523529011
126	NC_021730	A	6	6	5821	5826	100 %	0 %	0 %	0 %	523529011
127	NC_021730	TCA	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529011
128	NC_021730	G	6	6	5876	5881	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021730	TAG	2	6	5903	5908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021730	TTATA	2	10	5929	5938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021730	GTT	2	6	5956	5961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021730	TAAA	2	8	5968	5975	75 %	25 %	0 %	0 %	523529012
133	NC_021730	TAC	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529012
134	NC_021730	TGA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529012
135	NC_021730	ATTC	2	8	6201	6208	25 %	50 %	0 %	25 %	523529012
136	NC_021730	TAT	2	6	6239	6244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523529012
137	NC_021730	AGGA	2	8	6253	6260	50 %	0 %	50 %	0 %	523529012
138	NC_021730	AAT	2	6	6282	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
139	NC_021730	GTG	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523529012
140	NC_021730	TAC	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529012
141	NC_021730	CAG	2	6	6523	6528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523529012
142	NC_021730	CTC	2	6	6604	6609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523529012
143	NC_021730	AGA	2	6	6638	6643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529012
144	NC_021730	ATA	2	6	6742	6747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
145	NC_021730	ATG	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529012
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149	NC_021730	ATTA	2	8	6912	6919	50 %	50 %	0 %	0 %	523529012
150	NC_021730	TCA	2	6	6941	6946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529012
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152	NC_021730	ATG	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529012
153	NC_021730	TA	3	6	7080	7085	50 %	50 %	0 %	0 %	523529012
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178	NC_021730	AT	3	6	8321	8326	50 %	50 %	0 %	0 %	523529012
179	NC_021730	GAA	2	6	8338	8343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529012
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183	NC_021730	AGA	2	6	8409	8414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021730	GATTA	2	10	8430	8439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021730	T	6	6	8476	8481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021730	CAG	2	6	8499	8504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_021730	T	7	7	8609	8615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021730	CT	3	6	8696	8701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
189	NC_021730	CAA	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.